功能简介

主要功能特性

1. 1. MCPHub 认证：确保遵循模型上下文协议的最佳实践，提供可靠的生物医学数据访问。

2. 2. 填补知识空白：为生物医学领域弥补大语言模型缺乏特定领域信息和最新资源的不足。

3. 3. 结构化访问数据：提供对临床试验、生物医学文献和基因组变异的结构化访问。

4. 4. 自然语言查询：支持使用自然语言对专业数据库进行查询，无需了解特定语法。

5. 5. 支持研究工作流：通过一致的接口支持生物医学研究工作流。

6. 6. 作为 MCP 服务器：为人工智能助手和代理充当 MCP 服务器。

7. 7. 集成多数据源：整合了多个生物医学数据源，包括文献源和临床与基因组源。

8. 8. 提供专业工具：提供 13 个用于生物医学研究的专业工具，包括核心工具和个体工具。

快速开始指引

Claude Desktop 用户

1. 1. 若未安装 uv，进行安装：
• MacOS：brew install uv
• Windows/Linux：pip install uv

2. 2. 配置 Claude Desktop：
• 打开设置，导航到开发者部分。
• 点击“编辑配置”并添加配置。
• 重启 Claude Desktop 并开始聊天。

Python 包安装

1. 1. 使用 pip 安装：pip install biomcp-python

2. 2. 使用 uv 安装（推荐）：uv pip install biomcp-python

3. 3. 直接运行：uv run --with biomcp-python biomcp trial search --condition "lung cancer"

Tool 列表

• Think Tool：用于系统地分解复杂生物医学问题，规划多步研究方法，跟踪推理进度，确保全面分析。

• Search Tool：支持统一查询语言和基于领域的搜索，可进行跨领域和特定领域的搜索。

• Fetch Tool：用于检索单个文章、试验或变异的完整详细信息。

• article_searcher：搜索 PubMed/PubTator3 和预印本。

• article_getter：获取详细的文章信息。

• trial_searcher：搜索 ClinicalTrials.gov。

• trial_getter：获取所有试验详细信息。

• trial_protocol_getter：仅获取试验协议信息。

• trial_references_getter：获取试验出版物。

• trial_outcomes_getter：获取结果测量和结果。

• trial_locations_getter：获取站点位置和联系人。

• variant_searcher：搜索 MyVariant.info 数据库。

• variant_getter：获取全面的变异详细信息。

MCP配置

项目地址

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